Cooperarea interregională și transfrontalieră dintre Ucraina și Republica Moldova se realizează în cadrul acordurilor bilaterale dintre regiunile Ucrainei și Moldova, precum și în cadrul „Organizației pentru Democrație și Dezvoltare Economică” - GUAM”, euroregiunilor „Dunărea de Jos”, „Prutul de Sus” și „Nistru”.
Între unitățile administrativ-teritoriale ale Ucrainei (regiunile Cernăuți, Vinnița, Herson, Odesa, regiunile Cherkasy și Kiyv) au fost încheiate 22 de acorduri și protocoale de cooperare științifico-tehnică, umanitară și comercial-economică cu regiunile Republicii Moldova.
De asemenea, au fost încheiate 23 de acorduri între filialele regionale ale Camerei de Comerț și Industrie a Ucrainei și Camera de Comerț și Industrie a Republicii Moldova.
Euroregiunea „Dunărea de Jos” a fost creată la 14 august 1998. Euroregiunea cuprinde regiunea Odesa (Ucraina), județele Galați, Tulcea, Brăila (România), raioanele Cahul și Cantemir (Republica Moldova).
Crearea sa a avut ca scop realizarea unei dezvoltări economice armonioase și echilibrate; rezolvarea problemelor din domeniul protectiei mediului; asigurarea nivelului adecvat de ocupare a forței de muncă și protecție socială a populației; dezvoltarea infrastructurii de transport; formarea unui singur spațiu cultural în regiunea Dunării; prevenirea și lichidarea consecințelor dezastrelor naturale și tehnogene.
Euroregiunea „Prutul de Sus” a fost creată la 22 septembrie 2000. Include regiunea Cernăuți din Ucraina, municipiul Bălți și raioanele Briceni, Edineț, Fălești, Glodeni, Dondușeni, Rîșcani, Sîngerei din Republica Moldova, județele Botoșani și Suceava din România.
Euroregiunea „Nistru ” a fost creată la 2 februarie 2012. Acesta includea regiunea Vinița din Ucraina, raioanele Soroca, Șoldănești, Dondușeni, Florești, Rezina și Ocnița din Republica Moldova. Scopul principal a activității organizației este implementarea proiectelor transfrontaliere cu caracter ecologic, investiții, transport, comunicații și umanitar. Principalele evenimente ale Euroregiunii pot fi găsite pe pagina web: http://dniester.eu/.